学校的前身是创建于1935年的广东省立高级水产职业学校。

她是广东现代海洋水产教育的`发端，几经迁徙之后升格发展成农业部直属的湛江水产学院。1997年1月，由具有62年办学历史的湛江水产学院和39年办学历史的湛江农业专科学校实质性合并组建湛江海洋大学。

2001年12月，湛江气象学校并入湛江海洋大学。

2005年6月，经教育部批准，湛江海洋大学更名为广东海洋大学