南京大学校徽的左下方及右下方为英文"NANJING UNIVERSITY"是由南京大学英文校名。

校徽正中是南京的市树——雪松，寓意南大坚忍不拔的精神。南京的雪松已有 60 多年生长历史，南京已成为全国繁育雪松的基地，且雪松挺拔雄伟，品格刚毅，作为市树很具代表性。。雪松的下方为书图案及"1902"字样，点明南京大学的建校时间为1902年。校徽的上方中间部位圆形图案是由“南京大学”的艺术字体所组成的非常有设计感的图案。圆形图案两旁各有一只金陵辟邪(貔貅)，辟邪似狮而带翅膀，它能驱走邪秽、袯除不祥，也被认为是最能体现南京六朝古都形象的神兽，它象征着南京。