哈尔滨理工大学的学院有电气与电子工程学院，机械动力工程学院，材料科学与工程学院，计算机科学与技术学，自动化学院，测控技术与通信工程学院，管理学院，经济学院，应用科学学院，法学院，外国语学院，艺术学院，化学与环境工程学院，软件学院，建筑工程学院，国际文化教育学院，马克思主义学院，成人教育学院，后备军官学院，国际文化教育学院，荣成学院。

学校设有20个学院，1个教学部和1个教学实验中心，有59个本科专业，9个专科专业，有8个国家级第一类特色专业。