哈尔滨理工大学有四个校区，其中哈尔滨市三个，山东荣成一个。

哈尔滨理工大学西区位于哈尔滨市南岗区学府路52号，设有机械动力工程学院、电气与电子工程学院、自动化学院、计算机科学与技术学院、测控技术与通信工程学院、应用科学学院、建筑工程学院、马克思主义学院、国际文化教育学院、后备军官学院、成人与继续教育学院和体育教育部。哈尔滨理工大学东区位于哈尔滨市香坊区三大动力路23号，此校区设有软件学院，法学院。哈尔滨理工大学南区位于哈尔滨市南岗区征仪路249号，设有经管学、外国语学院、艺术学院、材料科学与工程学院、化学与环境工程学院。