深圳房产税的计算方法如下：

1. 计税依据：房产评估价值或交易价格，取两者中的较高者。

2. 税率：分为0.4%和0.6%两档，根据房产类型（普通住宅或非普通住宅）确定适用税率。

3. 免税面积：对个人拥有的唯一住房给予免税优惠，具体面积标准由地方政府规定。计算公式为：应纳税额=房产评估价值或交易价格×适用税率×（1-免税面积/房产总面积）。