西湖大学又称西湖高等研究院，目前招博士研究生。

学校开设的博士专业有生物学、生物医学工程、基础医学、计算机科学与技术、电子科学与技术、材料科学与工程、机械工程等12个一级学科，主要还是集中在理学、生命与健康、前沿技术等3个学科门类。