复等位基因（multiple alleles）是指在一个基因座上，存在两个或两个以上的等位基因，这些等位基因之间不是完全显性和完全隐性的关系，而是存在着不同程度的表型效应。

例如，人类的ABO血型系统就是一个典型的例子，A、B和O三种等位基因可以共存于同一群体中，它们之间的相互作用决定了个体的血型表现型。这种遗传现象有助于增加物种的遗传多样性，从而提高适应环境的能力。