上海理工大学的前身是1906年创办的沪江大学—上海理工大学军工路校区。

1900年，因庚子之变，美南浸信会的华中差会（在江苏传教）和美北浸礼会的华东差会（在浙江传教）成员都来到上海避难。期间他们达成了共识，决定在上海联合创办一所高等学校。1902年，在黄浦江畔的杨树浦军工路购得土地，开始建造校舍。

20世纪50年代初，原沪江大学和原国立上海高级机械职业学校（在原德文医工学堂校址）分别改建为上海机械学院（1994年更名为华东工业大学）和上海机械高等专科学校，1996年两校合并组建上海理工大学。1998年学校由原国家机械工业部转入上海市管理。