棉花种植过程中，主要使用的药物包括杀虫剂、杀菌剂和除草剂。

1. 杀虫剂：用于控制棉蚜虫、红蜘蛛等害虫。常用的有敌敌畏、乐果、氯氰菊酯等。

2. 杀菌剂：用于防治棉花病害，如枯萎病、黄萎病等。常用的有多菌灵、甲基托布津、代森锰锌等。

3. 除草剂：用于防除田间杂草，减少杂草与棉花争夺养分和水分。常用的有草甘膦、百草枯等。需要注意的是，使用这些药物时，必须按照说明书或农技人员的指导进行，避免过量使用造成环境污染和对人体健康的影响。同时，合理轮作、改善土壤结构和增强棉花自身抗病性也是降低病虫害发生的重要措施。