单体酶具有一级、二级、三级结构。

一级结构是指构成酶蛋白的氨基酸组成的一条长肽链或多肽链。二级结构是指肽链骨架相邻区段借助氢键等沿轴向方向建立的规则折叠片与螺旋。三级结构指在二级结构基础上肽链进一步的折叠片与盘绕成二维空间结构，多肽链中原来相距较远的序列可以集中到一个区域内。此基础上，由几个到十数个亚基（或单体）组成的寡聚酶或生物大分子称为酶的四级结构。酶的催化活性与酶的甲级有结构密切相关。