内蒙古财经学院共有两个校区。

东区为老校区，有30多年历史了，条件不好，新校区始建于2000年，为西校区，而且2010年9月28日内蒙古财经学院共有两个校区将举行50年校庆，西校区正在全面整修和建设，包括整体绿化，新教学楼，新体育场，新服务中心，届时都会竣工并投入使用。学校西校区具体地址为呼和浩特市北二环路185号（呼包公路2公里处）；高东校区具体地址为呼和浩特市海拉尔大街47号。