在河南自考本科中，药学专业的主考院校有以下几所：

郑州大学 ：郑州大学是河南省的211大学，也是排名第一的大学，提供药学专业的自考本科。

河南中医药大学 ：河南中医药大学是河南省内医学、药学相关专业报考的热门院校，也是河南省中医药行业人才培养的龙头和中心。

河南大学 ：河南大学是河南省最好的大学之一，也是报考成人高考的热门大学，提供药学专业的自考本科。

河南科技大学 ：河南科技大学是河南省内排名前三的大学之一，学校的综合实力强，药学是其优势专业。

河南理工大学 ：河南理工大学也可以报考河南省成人高考本科药学专业，学校的知名度较高，录取率也较其他学校高。

新乡医学院 ：新乡医学院是河南省著名的医学院校，以药学等学科为主，提供药学专业的自考本科。

新乡医学院三全学院 ：新乡医学院的独立学院，主要开设护理学、临床医学、药学等专业，也提供药学专业的自考本科。

建议选择主考院校时，可以综合考虑学校的教学质量、专业设置、社会声誉以及个人的职业规划和发展需求。