办理本科档案休学，你可以按照以下步骤操作：

提交休学申请 ：

向所在学院教务办提交书面休学申请，并领取并填写《休学申请表》或《保留学籍申请表》。

提交符合休学条件的相关证明材料，例如因病休学需提供医院诊断证明等。

学院审核 ：

所在学院相关负责人审核申请并签署意见，加盖学院公章。

将申请表和相关证明材料报教务处学籍管理科。

教务处批准 ：

教务处审核通过后，学生领取休学/保留学籍通知单，并按要求办理离校手续。

档案处理 ：

学校留存 ：如果选择将档案留存在学校，需向学校提出档案留存申请，申请通过后档案可留在学校档案馆，但一般只能留存在学校两年之内。

人才中心托管 ：将档案存放在户口所在地或生源地的人才中心，这是最常见且安全的方式。

专业档案机构 ：也可以选择将档案存放在社会上的专业档案保管机构，但需确保该机构具有国家认可的档案保管效力。

休学期间管理 ：

休学期间，学生需妥善保管个人档案，确保档案的安全和完整。

如果选择就业，且就业单位具有保管档案资格，可以将档案存放在就业单位。

复学手续 ：

休学期满后，需提前向学校提出复学申请，并提交健康证明等相关材料。

学校审核通过后，学生需办理复学手续，包括领取复学通知书，并完成相关流程。

建议：

在办理休学手续前，先咨询学校学籍档案管理部门或就业指导中心，了解具体的档案处理流程和注意事项。

确保所有提交的材料真实有效，以便顺利办理休学和复学手续。