基因频率的计算方法有：方法一：通过基因型个数计算基因频率。

某种基因的基因频率=此种基因的个数／（此种基因的个数+其等位基因的个数）方法二：通过基因型频率计算基因频某种基因的基因频率＝某种基因的纯合体频率+1/2杂合体频率方法三：根据遗传平衡定律计算基因频率(p+q)2=1,p2+2pq+q2=1，p+q=l。其中p代表一个等位基因的频率，q代表另一个等位基因的频率。运用此规律，已知基因型频率可求基因频率；反之，已知基因频率可求基因型频率。补充说明：遗传平衡定律：一个群体在符合一定条件的情况下，群体中各个体的比例可从一代到另一代维持不变。遗传平衡定律是由Hardy和Weinberg于1908年分别应用数学方法探讨群体中基因频率变化所得出一致结论。符合遗传平衡定律的群体，需满足的条件：（1）在一个很大的群体中；（2）随机婚配而非选择性婚配；（3）没有自然选择；（4） 没有突变发生；（5）没有大规模迁移。群体的基因频率和基因型频率在一代一代繁殖传代中保持不变。