生物降解这一术语通常针对有机污染物来使用。

有机污染物分子经过生物氧化或其他的生物转化而变成更小的分子的过程叫做生物降解或生化降解。有机污染物的生物降解具有重大环境意义，因为这是众多有机污染物在自然环境中的终结方式。各种生物机体都有降解污染物的能力，但由于微生物有着繁多的种类和很快的代谢速率，所以由微生物引起的生物降解最为重要。细菌是引起有机污染物生物降解的主体。好氧细菌、厌氧细菌、兼氧细菌都能对有机污染物产生降解作用。