1、池塘处理：池塘注水前一周，用100～300倍的em菌液代替石灰、漂白粉等均匀喷洒，消毒和净化池塘，每平方米按0.5～1公斤使用。

2、水质净化：在放养前3～10天，用em菌液泼洒水面，一亩水塘按一米水深使用1～2公斤，视水质情况，开始15天1次，以后为1个月1次，水质较差的地方，适当缩短泼洒时间或增加使用量。

3、饲料处理：每200公斤饲料加入1公斤的em菌液拌均匀后饲喂。

4、池塘湖泊水质处理：将em菌液直接稀释后泼洒，每亩约2公斤。