农村自建房悬浮顶的最佳尺寸应该根据实际情况而定，一般建议在3米×3米的范围内，这样既可以保证结构的稳定性，又可以节省材料和成本，同时也方便施工和维护。

但具体尺寸还需要根据具体地形、气候、土壤条件等因素进行综合考虑，以达到最佳的效果和安全性。