南京师范大学研究生院设有专业：

文学院：文艺学，语言学及应用语言学，汉语言文字学，中国古典文献学，中国古代文学，中国现当代文学

公共管理学院：哲学，政治学，行政管理，公共管理(专业学位)

商学院：区域经济学，金融学，产业经济学，国际贸易学，企业管理，技术经济及管理，金融(专业学位)，国际商务(专业学位)，工商管理(专业学位

社会发展学院：社会学,考古学,中国史，世界史，社会工作(专业学位)，文物与博物馆(专业学位）

化学与材料科学学院：化学，化学工程与技术，材料与化工(专业学位)

美术学院：美术学，设计学，美术(专业学位)