中国科学院数学与系统科学研究院简称中数院。

该院成立于1998年12月，是由中科院数学研究所（建于1952年）、应用数学研究所（建于1979年）、系统科学研究所（建于1979年）及计算数学与科学工程计算研究所（建于1995年）等四个研究所整合而成。根据2015年8月研究院官网显示，研究院有职工338余人，其中科研人员248人，包括中国科学院院士16人，中国工程院院士1人，第三世界科学院院士6人，中科院“百人计划”入选者和国家杰出青年基金获得者约80人，国家入选者4人，国家“青年”入选者3人。中国科学院院士：吴文俊、王元、杨乐、陆启铿、万哲先、石钟慈、林群、陈翰馥、马志明、严加安、陆汝钤、李邦河、郭雷、席南华、袁亚湘、周向宇中国工程院院士：崔俊芝国家：吴黎明、张寿武、范剑青、陈贵强国家“青年”：田一超、郑维喆、李文威科研部门根据2015年8月研究院官网显示，研究院除了下属的4个研究所以外，还有9个国家重点实验室、中科院重点实验室、研究中心。

2000年以来根据学科发展和实际需求又先后成立了13个交叉研究中心。此外，挂靠在研究院的全国一级学会有中国数学会、中国运筹学会、中国系统工程学会。