1994年，马特乌斯离开意大利，回到拜仁慕尼黑队，司职中后卫，帮助该队获得1996～1997赛季的德国甲级联赛冠军和欧洲联盟杯赛冠军。

但这一年，也是他与克林斯曼的矛盾闹得纷纷扬扬的一年。

2000年3月10日，马特乌斯结束了在拜仁慕尼黑队的合同，转会到美国职业大联盟球队纽约地铁明星队。马特乌斯是一位足球全才。贝肯鲍尔曾赞扬他是当今世界上最好的球员之一。他把各个位置的经验很好地结合在一起，是位不可多得的全才。他可以轻松地踢好任何一个位置，不论是进攻还是防守他都是一流的，是一个让教练和队友放心的人。