一、组成结构不同1、氨基：氨基（Amino）是有机化学中的基本碱基，所有含有氨基的有机物都有一定碱的特性，由一个氮原子和两个氢原子组成。

2、胺基：胺基是氨的氢原子被烷基代替后的有机化合物。

二、作用不同1、氨基：氨基是一个活性大、易被氧化的基团。在有机合成中需要用易于脱去的基团进行保护。酰化保护，即用酸酐保护，手性化合物常用CBZ，BOC，FMOC等保护氨基酸，氨基显正电性，是斥电子集团，在氨基酸合成多肽时，氨基能与羧基发生脱水缩合。

2、胺基：绝大多数药物都含有胺的官能团——胺基。蛋白质、核酸、许多激素、抗生素和生物碱，都含有胺基，是胺的复杂衍生物.