取决于具体情况和目的。

以下是一些考虑因素：

1. **形式正式**：公文系统通常用于正式的商务或官方通信。通过公文系统转发的感谢信可能会被视为更正式和官方的感谢表达方式。

2. **记录保存**：公文系统中的文件通常会有记录，这对于需要保存证据或历史记录的情况很有用。

3. **传达范围**：公文系统可以确保感谢信被传达给指定的接收者，如果是内部系统，还可以确保只有授权人员能够访问。

4. **速度和效率**：公文系统通常较慢，因为它需要经过多个审批和转发环节。如果需要快速传达感谢，可能需要考虑其他更快的通信方式。

5. **个人触摸**：公文系统转发的感谢信可能缺乏个人触摸，因为它可能看起来更像是官方文件而不是个人致谢。

6. **适用场合**：如果是在正式的商务环境或官方场合，通过公文系统转发的感谢信可能是合适的选择。但如果是在非正式或个人场合，可能需要更个性化的感谢方式。

7. **文化和习惯**：不同的组织和文化对于感谢信的期望和习惯不同。在一些文化中，公文系统转发的感谢信可能被视为正式和恰当，而在其他文化中，可能更倾向于直接的个人交流。总之，通过公文系统转发的感谢信可以在某些情况下是有效的，特别是当需要正式记录或在官方场合表达感谢时。然而，根据具体情况和接收者的期望，可能需要考虑其他更个性化的感谢方式。