1.细胞：这里包括各种动植物组织器官分离得到的细胞（在体也可观察，比如观察洋葱表皮细胞，做成切片标本等）；体外培养的动植物细胞（比如癌细胞）；2.微生物：这里包括各种细菌、真菌、病毒等等。

3.单细胞动物：即原生动物门中的单细胞动物，像草履虫等等。

4.单细胞植物：这主要指的就是单细胞的藻类，像小球藻等等。这里基本属于浮游植物了（也有底栖）。

5.其他微小动物：有些动物门里的动物个体非常微小，比如轮虫等也需显微镜观察。有些大型动物的幼虫也是非常小，需要显微镜观察，比如海参的幼虫。这些基本属于浮游动物了。另外，显微镜技术发展很快，细胞内的更加细微的结构，可以利用电子显微镜等更高级的显微技术观察到。