湖南农业大学开设了农学、园艺、植物保护、生物科学、微生物学、动物医学、动物科学、水产养殖科学、食品科学与工程、农业电气化、农业装备工程、农业水利工程、农业建筑环境与能源工程、动物药学、畜牧学、兽医学、水产养殖学、水生生物学、草业科学、林学、林业工程、森林保护等22个本科专业和160个研究生专业。

其中，农学、植物保护、动物医学、水产养殖科学、食品科学与工程、草业科学、林学七个学科为国家重点学科。