昌吉学院总共有2个校区，分别为南、北两个校区。

一、昌吉学院总共有几个校区南校区：新疆昌吉市世纪大道9号北校区：新疆昌吉市北京北路77号占地面积800余亩，各类建筑面积20万平方米。有包括外国留学生在内的各类全日制在校生7200多人。

2014年学院官网显示，学院设有中文系、中语系、经济管理系、外语系、社会科学系、数学系、物理系、化学工程系、计算机工程系、体育系、音乐系、美术系、初等教育学院、成人教育学院14个教学系(院);开设42个本科专业(含疆内定向免费师范生专业)、15个专科专业(含疆内定向免费师范生专业)。