分别是雅安校区、成都校区、都江堰区。

1、四川农业大学雅安校区：四川省雅安市雨城区新康路46号。四川农业大学雅安校本部校区与雅安市区共生，占地面积几乎相当于三分之一个雅安市区。雅安校区由濆江分隔老校区和新校区，学校的所有机关职能部门均设置在雅安校区，是学校的“政治”中心。

2、四川农业大学本成都校区成都市温江区惠民路211号邮编：611130。四川农业大学成都校区位于成都市温江区，占地面积600余亩。其前身是1988年经四川省人民政府批准成立的四川农业大学水稻研究所。1990年12月，水稻研究所从雅安迁到温江。

3、四川农业大学都江堰校区：成都市都江堰市建设路288号邮编：611830。四川农业大学都江堰校区位于世界旅游文化城市都江堰占地面积1660余亩，校舍建筑面积12余万平方米。其前身是1953年成立的四川省林业学校；

2001年4月整体并入四川农业大学设立都江堰分校2009年11月更名为四川农业大学都江堰校区(2012年2月原小麦研究所地块整体置入都江堰校区)。