现在的吉首大学是由原来的吉首大学合并了湘西州人民医院、张家界市武陵高等专科学院和吉首卫生学校的一所湖南省高等教育学校。

在有评估的47个本科专业中，以音乐学为最好的专业，全国排在第24名，是唯一的一个A等级专业；其次的B+等级专业有小学教育、民族传统体育、工商管理、市场营销。这5个专业可以算是吉首大学最好的5个专业了。