生物显微镜倍镜可以分为物镜倍镜和目镜倍镜两部分。

物镜倍镜是放置在下方的物镜，通过透镜使样本放大，并且捕捉到更多的细节；而目镜倍镜是放置在上方的镜头，用于放大物镜下的影像。一个标准的生物显微镜通常具有10X或20X物镜倍镜和10X或15X目镜倍镜，使得样本的总放大倍数可以达到100X或者300X。物镜和目镜的放大倍数越高，所获得的细节越清晰，但是视野也会相应减小。