南京理工大学只有一个校区，南京市玄武区孝陵卫街200号，本校区纯一本。

校区很大，占地3000多亩。南京理工大学下面还有独立学院，包括紫金学院（仙林大学城）和泰州科技学院（泰州）。，以及继续教育学院。所有的这些独立学院和继续教育学院都不在孝陵卫200号。