各有有缺点，主要看处理哪类水质。

比如生活废水，物理化学法，成本就高了。工业废水一般不能直接生化，得先物理化学预处理。或者投加营养使其CNP比例满足生化要求。好氧生化处理COD上线在1200mg/L，不然要物化预处理加配水工业废水化学法缺点可能会处理的不干净。水污染是由有害化学物质造成水的使用价值降低或丧失。污水中的酸、碱、氧化剂,以及铜、镉、汞、砷等化合物,苯、二氯乙烷、乙二醇等有机毒物,会毒死水生生物,影响饮用水源、风景区景观。污水中的有机物被微生物分解时消耗水中的氧,影响水生生物的生命,水中溶解氧耗尽后,有机物进行厌氧分解,产生硫化氢、硫醇等难闻气体,使水质进一步恶化。