上海大学生命科学学院下设植物学系、神经生物学系、生物化学系、生物技术系、食品科学与营养学系5个教学系。

拥有上海市能源作物育种及应用重点实验室、PI实验室（包括陈沁实验室、高旻天实验室、胡向阳实验室、吉永华实验室、李根喜实验室、罗利实验室、马衍青实验室、孟祥宗实验室、宋任涛实验室、文铁桥实验室、翁新楚实验室、肖俊杰实验室、张卫实验室等13个PI实验室）、上海大学生物膜与生物药学研究所、上海大学生物电子学研究所、上海大学生物安全与信息分析中心、上海大学崇西湿地科学实验站、上海大学生命科学实验中心、上海大学生物工程中心等教学科研公共平台。