上海交通大学共有28个学院/直属系，有本科专业64个，涵盖经济学、法学、文学、理学、工学、农学、医学、管理学和艺术等九个学科门类。

在上海交通大学众多的优秀专业中，称得上最好的专业有28个专业，这些专业是国家级重点学科，也可以说是上海交通大学的人才聚集地。 2018年3月，上海交大本科新增统计学、天文学、临床药学专业。