吉首大学位于湖南省湘西土家族苗族自治州吉首市，共有6个校区。

其中，吉首市有4个校区，分别是砂子坳校区、大田湾校区、石家冲校区、雷公井校区；张家界市有2个校区，分别是三角坪校区、热水坑校区。因此，吉首大学既位于吉首市，也在张家界市。