深圳初中生物教材使用的是人教版版本。

该版本是由教育部审定，并由人民教育出版社出版。它涵盖了生物学的基础知识，包括细胞、组织、器官、人体生理、植物生长等方面的内容。此外，深圳一些外国语学校可能会使用自己编写的教材，但大多数学校还是使用人教版的教材。总的来说，深圳初中生物教材以人教版为主，注重学生的实际需求和认知规律，旨在培养学生的生物学素养和探究能力。