南阳市三中实验班和领航班是南阳市第三中学开设的两个特殊班级，它们有一定的区别。

1. 招生对象：南阳市三中实验班是为高中阶段拔尖学生而设立的特殊班级，主要面向成绩优秀、学习能力强的学生。而领航班是为初中阶段优秀学生而设立的特殊班级，主要面向中学入学考试成绩优秀的学生。

2. 学习内容：三中实验班注重高中阶段的学术培养，强化学生的学科知识和能力，同时注重探究学习和科研能力的培养。领航班注重初中阶段学习方法和基础知识的培养，强化各科学科的学习，为学生打下坚实的中学学习基础。

3. 学科设置：三中实验班的学科设置与普通班级相似，但注重深入学习和针对高考的培养；领航班学科设置相对较全面，涵盖了语文、数学、英语、物理、化学、生物、政治、历史、地理等。

4. 教学方式：三中实验班注重研究性学习和课外科研活动的开展，鼓励学生自主学习和发展创新思维；领航班注重基础知识的讲解和习题的训练，帮助学生打牢中学知识基础。

5. 教学资源：三中实验班享受学校提供的更多优质教学资源，如教育设施、师资力量等；领航班也会提供较为优质的教学资源，但可能相对于实验班要少一些。总的来说，三中实验班注重高中阶段学术能力的培养，更加注重研究性学习和科研能力的培养；领航班则注重初中阶段学习方法和基础知识的培养，为学生打下坚实的中学学习基础。