长江里有中华鲟、白鲟、达氏鲟、白鳍豚、扬子鳄、江豚、胭脂鱼、淞江鲈等危险生物，但是因长江生态环境发生了变化，水质污染、江湖淤塞、使用有害渔具及有害捕捞方法，很多动物已经濒危。

长江作为中国第一大河，是生物多样性最典型的生态河流，也是我国众多珍稀濒危水生野生动物的重要栖息繁衍场所。据统计，长江流域共有淡水鱼类378种，包括特有鱼类142种，拥有国家一、二级重点保护水生野生动物14种，很多动物都是长江特有。