复旦大学微生物研究生考试的难度因人而异。

总体来说，复旦大学微生物学科在国内处于领先地位，其研究生招生要求也相对较高。因此，对于想要报考复旦大学微生物研究生的同学来说，需要具备扎实的学科基础、良好的实验技能和一定的研究经验。同时，在备考过程中，还需要注重全面复习、提前规划、模拟测试等环节，以提高自己的竞争力。