根据2025年的最新排名，北京市最好的大学排名如下：
清华大学：全国排名第一，理工科领域的领军者。
北京大学：全国排名第二，文理兼优的综合性大学。
中国人民大学：全国排名第八，人文社会科学领域的顶尖学府。
北京航空航天大学：全国排名第十，航空航天领域的王牌院校。
北京理工大学：全国排名第十七，国防工业领域的重点院校。
北京师范大学：全国排名第十八，教育学领域的“常青树”。
北京协和医学院：全国排名第三十，医学界的顶尖院校。
中国农业大学：全国排名第三十一，农业科学领域的领先院校。
中央财经大学：全国排名第三十五，财经类院校的佼佼者。
北京交通大学：全国排名第三十九，交通运输工程领域的重点院校。
这些大学在各自的领域都表现突出，涵盖了理工、人文、医学、农业等多个学科，展现了北京高等教育的多元化和高水平。