两个孩子法院会怎么判

一般来说，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。但是如果存在母亲抚养不利于未成年子女成长的情形的，可以由父亲抚养。对于子女的抚养权归属，可以由父母双方进行协议约定，

法律依据

2021年生效的《民法典》第一千零八十四条第三款
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。