员工与公司发生纠纷,可以找劳动行政部门;找本单位的劳动争议调解委员会;或者也可以依法找劳动争议仲裁委员会、人民法院,通过仲裁、起诉的方式来解决纠纷。
法律依据
《中华人民共和国劳动法》第七十七条
用人单位与劳动者发生劳动争议,当事人可以依法申请调解、仲裁、提起诉讼,也可以协商解决。第七十九条劳动争议发生后,当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解;调解不成,当事人一方要求仲裁的,可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的,可以向人民法院提起诉讼。