传染病菌种毒种扩散罪的判刑规定是:构成该罪,后果严重的,处三年以下有期徒刑或者拘役;后果特别严重的,处三年以上七年以下有期徒刑。该罪为特殊主体,主要是指从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员。
法律依据
《中华人民共和国刑法》第三百三十一条 传染病菌种、毒种扩散罪
从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员,违反国务院卫生行政部门的有关规定,造成传染病菌种、毒种扩散,后果严重的,处三年以下有期徒刑或者拘役;后果特别严重的,处三年以上七年以下有期徒刑。