公司合同诈骗不能立案的,可以向公安机关申请复议,也可以向人民检察院提出。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的,会通知公安机关立案。以非法占有为目的,在签订、履行合同过程中,骗取对方当事人财物,数额在二万元以上的,构成合同诈骗罪,应予立案追诉。
法律依据
《刑事诉讼法》第一百一十三条
人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的,或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查,向人民检察院提出的,人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的,应当通知公安机关立案,公安机关接到通知后应当立案。