企业收到运费发票，账务处理如下：
1、取得运费发票时：
借：管理费用等（根据费用归属部门计入相关科目）
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：应付账款——公司名称
2、支付相关费用时：
借：应付账款——公司名称
贷：银行存款
其中，企业为小规模纳税人时，收到运费发票并支付的分录为：
借：管理费用等（根据费用归属部门计入相关科目）
贷：银行存款
需注意的是，企业发生的运费为采购存货时所产生的费用的，需计入存货的成本中。存货的采购成本一般包括采购价格、进口关税和其他税金、运输费、装卸费、保险费以及其他可直接归属于存货采购的费用。