男方不能生育试管婴儿在离婚时抚养权可以协商处理,若协商不成的可以向法院请求判决。

一般情形下两周岁以下的一般情况归母亲抚养,特殊情形除外,例如母亲患有重大疾病或传染病等,已满两周岁的子女会优先考虑失去生育能力的男方。未得到抚养权的一方仍需负抚养义务,及时支付抚养费。
法律依据
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条父母与子女间的关系,不因父母离婚而消除。离婚后,子女无论由父或者母直接抚养,仍是父母双方的子女。离婚后,父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后,不满两周岁的子女,以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女,父母双方对抚养问题协议不成的,由人民法院根据双方的具体情况,按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的,应当尊重其真实意愿。