如何确定股权转让协议纠纷法院管辖

股权转让协议纠纷管辖法院有两个。被告的住所地以及合同的履行地，根据相关法律规定，被告若是法人，则是营业执照上载明的地址为住所地。股权变更需要登记。

法律依据

《民事诉讼法》第二十三条

因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。

第二十四条

因保险合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者保险标的物所在地人民法院管辖。

第二十五条

因票据纠纷提起的诉讼，由票据支付地或者被告住所地人民法院管辖。