发票未核销公司可能会被税务机关进行处罚。不核销不是不抵扣的意思,核销是销账,就是减少坏账。收到发票之后就可以核销相应账目,对于确实无法收回的应收款项,按管理权限报经批准后作为坏账损失,转销应收款项,借记坏账准备;贷记应收票据、应收账款、应收利息、其他应收款。
法律依据

《发票管理办法》第十九条销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人,对外发生经营业务收取款项,收款方应当向付款方开具发票;特殊情况下,由付款方向收款方开具发票。第二十条所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项,应当向收款方取得发票。取得发票时,不得要求变更品名和金额。