公司总经理辞职只要提前三十天已书面形式通知用人单位,按照公司规定提出离职就是合法的。如果双方协商一致的,也是合法辞职;如果是还在试用期的,则只需要提前三天通知用人单位即可。
法律依据

《劳动合同法》第三十六条用人单位与劳动者协商一致,可以解除劳动合同。第三十七条

劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位,可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位,可以解除劳动合同。第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同,或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制,给用人单位造成损失的,应当承担赔偿责任。