公司恶意扣员工工资怎么办

公司恶意扣员工工资的，员工可以通过以下方法维权：与公司协商；向劳动争议调解组织申请调解；向劳动行政部门投诉；向人民法院请求支付令；向工会求助；向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；其他。

法律依据

《劳动争议调解仲裁法》第五条

发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。