夫妻在女方孕期协议离婚了的,孩子出生时的户口应当到直接抚养孩子的一方所在地的派出所办理登记手续。
法律规定婴儿出生后一个月以内,应当由户主、亲属、抚养人或者邻居向婴儿常住地的户口登记机关申报出生登记。
法律依据
《中华人民共和国户口登记条例》 第七条婴儿出生后一个月以内,由户主、亲属、抚养人或者邻居向婴儿常住地户口登记机关申报出生登记。弃婴,由收养人或者育婴机关向户口登记机关申报出生登记。《中华人民共和国户口登记条例》 第四条户口登记机关应当设立户口登记簿。
城市、水上和设有公安派出所的镇,应当每户发给一个户口簿。农村以合作社为单位发给户口簿;合作社以外的户口不发给户口簿。户口登记簿和户口簿登记的事项,具有证明公民身份的效力。