公司股权转让有短期负债可以与当事人协商处理。当事人不同意转让的,可以要求公司提前清偿债务。公司股权转让后,新股东以其认缴的出资额或者认购的股份为限对公司承担责任。
法律依据
《中华人民共和国公司法》第三条
公司是企业法人,有独立的法人财产,享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任;股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。《中华人民共和国民法典》第五十七条法人是具有民事权利能力和民事行为能力,依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织。